虚开发票的查处多由税务机关与公安机关联合展开，通过多维度取证来固定违法事实。以下按不同情形为你解析查处流程：
若发现发票信息与实际交易不符，税务机关会比对发票记载的货物名称、数量、金额等与企业真实经营数据（如出入库单、合同等），排查疑点。例如，企业开票金额远超其实际生产或采购能力，可能被认定为虚开。
若存在资金流向异常，侦查机关将核查与发票相关的银行流水。如开票方与受票方无真实资金往来，或资金短期内异常回流，此类“空转资金”行为是重要查处线索。
若有主观故意证据（如通讯记录、会议纪要等显示明知无真实交易仍参与开票），将直接影响违法性质认定。例如，会计聊天记录明确提及“帮客户虚开”，可作为主观故意的关键证据。
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虚开发票查处有明确法律依据，《中华人民共和国刑法》第二百零五条对其认定与处罚作出具体规定。
该法条明确，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，包含为他人虚开、为自己虚开、让他人为自己虚开、介绍他人虚开四种行为。查处时，税务机关和公安机关会先依据此条确认是否存在上述行为。例如，企业为无实际业务的关联公司开具增值税专用发票，即属“为他人虚开”。
同时，法条根据虚开税款数额和情节严重程度设置不同刑罚档次。查处时会结合虚开税款金额（如是否达到“数额较大”“数额巨大”标准）及其他严重情节（如多次虚开、造成国家税款重大损失等）综合判定。例如，虚开税款1万元以上即构成犯罪并面临刑事处罚，为查处后的法律追责提供明确标准。
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虚开发票被查处后将面临多种法律风险，举例说明如下：
1、刑事责任风险：虚开发票达到一定数额或情节严重时，构成虚开发票罪或虚开增值税专用发票罪。例如，某公司为少缴税款让他人为自己虚开增值税专用发票，虚开税款10万元，根据《刑法》第二百零五条，该公司及直接责任人员可能被处三年以下有期徒刑或拘役，并处相应罚金；若虚开税款数额巨大（如超50万元），则可能面临十年以上有期徒刑甚至无期徒刑。
2、经济损失风险：除刑事责任外，还需承担补缴税款、滞纳金及罚款的经济后果。例如，某企业虚开普通发票50万元，被税务机关查处后，需补缴相应税款（如增值税、企业所得税等），按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金，并可能被处虚开金额1-5倍罚款，总经济损失可能远超虚开金额本身。
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虚开发票的查处结果可能因特殊或例外情形有所不同，分析如下：
1、被迫虚开发票的情形：若行为人在胁迫（如暴力威胁、以家人安全要挟等）下实施虚开发票，且能提供充分证据证明被胁迫事实，根据《刑法》第二十八条“胁从犯”规定，可能减轻或免除处罚。例如，会计在老板以解雇并扣发工资威胁下虚开发票，若有录音、聊天记录等证据，查处时司法机关会考虑其被迫情节从轻处理。
2、主动投案并如实供述的情形：行为人在虚开发票行为未被司法机关发觉前，主动向税务机关或公安机关投案并如实供述罪行，构成自首。根据《刑法》第六十七条，自首可从轻或减轻处罚；犯罪较轻的，可免除处罚。例如，企业负责人发现虚开发票后主动自首并积极补缴税款，查处时可能大幅降低刑期或罚款。
3、不知情参与虚开发票的情形：若行为人（如普通财务人员）对虚开发票不知情，仅按领导指示正常履职，且能证明已尽合理审查义务（如核对表面真实的合同和单据），则可能因缺乏主观故意不被认定为犯罪。例如，会计根据公司提供的虚假但形式完整的采购合同开票，自身不知合同虚构，查处时可能无需承担刑事责任。

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